1. Model Hubungan Kuantitatif Struktur-Aktivitas (HKSA) adalah model regresi atau model klasifikasi yang digunakan dalam ilmu-ilmu biologi, kimia, Kimia Medisinal, dan ilmu teknik. Seperti model regresi lainnya, model HKSA adalah model regresi yang berhubungan dengan satu set "prediktor" variabel (X) terhadap potensi dari variabel respon (Y), sedangkan klasifikasi HKSA adalah model yang berhubungan dengan variabel prediktor untuk kategoris nilai dari variabel respon.[1]

Tentang HKSA

sunting

Dalam pemodelan HKSA, prediktor terdiri dari sifat fisiko-kimia atau penjelas molekul teoretis bahan kimia; variabel respon HKSA bisa menjadi aktivitas biologis bahan kimia. Model HKSA pertama meringkas hubungan yang seharusnya antara struktur kimia dan aktivitas biologis dalam kumpulan data bahan kimia. Kedua, model HKSA memprediksi aktivitas bahan kimia baru.

Istilah terkait mencakup hubungan struktur-properti kuantitatif (HSPK) ketika properti kimia dimodelkan sebagai variabel respons. "Sifat atau perilaku molekul kimia yang berbeda telah diselidiki dalam bidang HSPK. Beberapa contoh adalah hubungan struktur-reaktivitas kuantitatif (HSRK), hubungan struktur-kromatografi kuantitatif (HSKK) dan, struktur kuantitatif-hubungan toksisitas (SKHT), hubungan struktur-elektrokimia kuantitatif (HSEK), dan hubungan struktur-biodegradabilitas kuantitatif (HSBK)".[2]

Sebagai contohnya, aktivitas biologis dapat dinyatakan secara kuantitatif sebagai konsentrasi zat yang diperlukan untuk memberikan respons biologis tertentu. Selain itu, ketika sifat fisikokimia atau struktur diekspresikan oleh angka, seseorang dapat menemukan hubungan matematika, atau hubungan struktur-aktivitas kuantitatif, di antara keduanya. Ekspresi matematika, HKSAmemiliki bentuk model matematika:

  • Aktivitas = f (sifat fisiokimia dan/atau sifat struktural) + kesalahan

Artinya sifat fisiokimia dan/sifat struktural + kesalahan termasuk kesalahan model (bias) dan variabilitas pengamatan, yaitu variabilitas dalam pengamatan bahkan pada model yang benar.[3]

  • Analisis hubungan kuantitatif struktur dan aktivitas (HKSA) dilakukan untuk senyawa turunan triazolopiperazin amida untuk menghibisi enzim DPP IV penyebab diabetes melitus tipe 2. Analisis ini dilakukan dengan pemodelan molekul turunan triazolopiperazin amida dan perhitungan deskriptor HKSA menggunakan metode semiempirik PM3 dengan program Hyperchemร’. Analisis data menggunakan metode analisis regresi multilinear untuk parameter elektronik dan molekular dengan program SPSSร’. Persamaan terbaik yang diperoleh adalah:
    • -log IC50 = 79,955 - (11,635*qC1) - (2,094*qC2) - (34,6*qN11) + (797,684*qC15) + (0,288*m)
    • n = 18; r = 0,714; adjusted r2 = 0,305; Fhit/Ftab = 1,239; PRESS = 0,017.
  • Berdasarkan persamaan tersebut, senyawa dengan aktivitas terbaik yang diusulkan adalah
    • (2R) - 4-Okso - 4 - [3 - (Trifluorometil) - 5,6 - dihidro [1,2,4] triazolo [4,3 -a] pirazin - 7 (8H) - il] - 1 - (2 - fluoro - 4,6 - dihidroksofenil) butan - 2 -amina dengan harga โ€“log IC50 = 8,601. [4]

Referensi

sunting
  1. ^ https://doi.org/10.17877%252FDE290R-690
  2. ^ https://doi.org/10.1016%2Fj.drudis.2018.06.016
  3. ^ https://books.google.com/books%3Fid%3DFFcSCAAAQBAJ%26pg%3DPA4[pranala nonaktif permanen]
  4. ^ "Analisis HKSA Senyawa Antidiabetik Turunan Triazolopiperazin Amida Menggunagan Metode Semiempirik PM3". Alchemy. 5 (4). 2017.

๐Ÿ“š Artikel Terkait di Wikipedia

Kimia medisinal

melakukan kajian terhadap obat yang sudah ada, berikut sifat biologis serta QSAR (quantitative structure-activity relationships)-nya. Bidang ini berfokus

Antagonis reseptor H2

obat terlaris pertama. Penggunaan hubungan kuantitatif struktur-aktivitas (QSAR) menyebabkan pengembangan agen lain, dimulai dengan ranitidin yang pertama

ChemSpider

NMRShiftDB PANACHE PCMD PDSP Peptides Prous Science Drugs of the Future QSAR R&D Chemicals San Diego Center for Chemical Genomics SGCOxCompounds, SGCStoCompounds

Aturan lima Lipinski

berdasarkan struktur yang diprediksi Penemuan kandidat obat berbasis fragmen QSAR (hubungan kuantitatif struktur-aktivitas) Lipinski CA, Lombardo F, Dominy

Pangkalan data kimia

kombinasi deskriptor fisiko-kimia yang serupa dengan menggunakan metode QSAR. Sistem pangkalan data untuk memelihara catatan unik pada senyawa kimia disebut

Informatika kimia

Diarsipkan 2006-06-14 di Wayback Machine. The Cheminformatics and QSAR Society UK-QSAR and ChemoInformatics Group Education and Research at the University

Hubungan strukturโ€“aktivitas

biologis, yang dikenal sebagai hubungan kuantitatif struktur-aktivitas (QSAR). Istilah terkait adalah hubungan struktur-afinitas (SAFIR). Banyaknya senyawa

Koefisien partisi

Informatika kimia ADME Lima aturan Lipinski Bioinformatika Efisiensi lipofilik QSAR Hukum distribusi Farmakokinetik Kimia kombinatorial ITIES Diagram partisi